Вопрос Через какую программу делается подобный дизайн?

фотошоп

Это на сайте? Все очень просто это явка. ну или нечто подобное объясню на явке, когда мышь начинает двигаться это событиевсе эти твои точки это отдельные элементы при событии движения мышкой они начинают перемещаться потому что так написано для них в скрипте ну и коннечно не составит труда получить положение курсора мышки и направление движение при этом. это намного проще чем кажется.